[TieLay]

Ametist, возможно дребезг мыши, как вариант увеличь время между кликами в настройках.
Или загрузись с LiveCD и проверь поведение мыши в нём.
Да и ещё, т.к. глюк не систематический, то, в случае проводной мыши, проверь провод, возможно дело в нём.