[Azagthtot]

SELECT count(*) 
		FROM characters c
		LEFT JOIN character_subclasses cs ON cs.char_obj_id = c.obj_id AND cs.isBase=1
		LEFT JOIN char_templates ct ON cs.class_id = ct.ClassId  and ct.RaceId=0
		WHERE c.access_level in (0,1)

Во первых, в where лучше писать условия к основной таблице (понятнее), во-вторых, точно LEFT JOIN? а не INNER?