MDLDecompiler (5 версия), извлекаете архив в sourcesdk\bin\ep1\bin\ и запускаете. Снимаете галочку с Use Steam File Access.
Программе нужно указать пусть к .MDL и если копируете отдельно модель то не забывайте также скопировать modelname.dx80.vtx и modelname.dx90.vtx