[Fudji]

Мб я буду злостным капитаном очевидность, но у Mysql есть лог /var/log/mysql
По нему будет видно мускул это или нет.
Обновить Mysql с репозиториев можно командой apt-get update apt-get upgrade.
max_connections = 2500 оптимально для 8 ГБ озу.

Нужно больше информации.