[zaqwer]

На 2 и 3.
2) Заливать в базу новые файлы из папки Update. Я так давно делаю, всё в норме.
3) Тем что компилируют исходники, которые можно менять по вкусу, например: ставить патчи, вместо того чтобы качать сборку и каждый раз менять конфиги, занести в исходник. Далее компилировать и запускать сервер.