Не раз не видел мануалов... по сборкам,
я вот тоже начинающий можно сказать на яве ну может месяц что-то делаю,
но на других языках же достаточно давно
для понимания сборки могу дать пару советов
1. для начала обзаведитесь нормальным IDE для редактирования, я использую Eclipse
2. Ну и потом читайте название файлов классов и методов . название в большенстве чвоем несет ответ на вопрос что происходит в классе - методе
3. ну и по структуре
loginserver - содержит в себе ве по логину
gameserver - соответственно по игровому
как и говорил названия сами за себя говорят
в каждой их них есть папки
serverpackets и clientpackets - это соответственно классы для работы с пакетами
в model - располагаются вс модли , НПЦ, игроки, скилы , вещи , пати , кланы, и т.д.
иногда для исправления бага или для понимания как что работает нжно знать какое действие инициируется например при нажатии на какую нибудь кнопку в интерфейсе игры, для того чтоб понять откуда ноги растут я использую программу l2phx(
http://coderx.ru) смотрим пакет какой отправляется, имена пакетов в l2phx
соответствуют названиям классов отвечающих за их обработку, тут и начинается разбор полетов
Удачи в начинании